토와, 세츠나, 모로하는 요괴와 인간의 피를 이어받는 반요의 소녀들이다.

어린 시절 숲의 화재에 휩쓸려 헤어진 쌍둥이 소녀, 토와와 세츠나. 언니인 토와는 시대수의 시공을 넘는 터널로 전국시대부터 현대에 시간여행을 해, 카고메의 남동생 소타의 도움을 받은 것을 계기로 히구라시 가의 딸로 양육되어 무도를 잘하는 중학생으로 성장했다.

한편, 전국시대에 남겨진 여동생인 세츠나는 요괴 퇴치사의 우두머리가 된 코하쿠 밑에서 요괴 퇴치를 생업으로 하고 있었다.

카고메와 이누야샤의 딸 모로하 역시 현상금 사냥꾼으로 '귀신 잡는 모로하'란 별명을 얻으며 역시 요괴 퇴치를 일삼고 있다.

토와와 세츠나가 헤어진 지 10년, 시대수의 시공을 넘는 터널이 다시 열린다.

토와는 현대에 온 세츠나와 재회하지만, 그녀는 왜인지 토와를 잊어버리고 있었다.

이렇게 되어 세츠나와 같이 현대에 온 모로하가 가세해 그녀들 "반요 야차공주"가 현대와 전국시대를 종횡무진 뛰어다닌다.