영주 부석교회 구 본당은 건립 당시의 건축적 상황들을 잘 이해할 수 있으며, 특히 흙벽돌을 이용하여 축조한 벽체와 목조로 된 첨탑 등이 비교적 원형의 모습을 간직하고 있어 희소성 및 진정성 측면에서 국가등록문화유산으로서의 가치가 있는 것으로 평가된다.